الملفت أن السور تتطابق من ناحية النص والرسم و سياق الآيات مع المصحف الحالي إلا باختلافات بسيطة عدة بالرسم و القراءة القرآنية
الاختلافات التي وجدت هي في عشر آيات بسور : الكهف, العنكبوت, السجدة, النمل, سبأ, الشعراء, النور.
ولأجل التحقق من قراءة هذه الاختلافات رجعنا إلى موسوعة معجم القراءات , حيث تبين من خلالها, أن أربع من هذه الاختلافات معروف لمن تعود قراءتها, والبقية لم يذكر حولها شيء في معجم القراءات و لذلك اعتبرناها غير معروفة القراءة. ويذكر في هذا الصدد بأن قراءات كثيرة للقرآن الكريم قد اندثرت على مر الزمن و لم تعد معروفة, بينما انتشرت واشتهرت قراءة حفص عن عاصم بالصحف بالرسم العثماني في مختلف البلدان الإسلامية وانتشرت قراءة قالون عن نافع في ليبيا و تونس و قراءة ورش عن نافع في الجزائر والمغرب وموريتانيا.
أدناه , صور الاختلافات التي في المخطوطة مع المصحف بقراءة حفص عن عاصم بالرسم العثماني و هي بحسب الترتيب التالي:
الكهف , الآية 58.. ذو الرحمة.. ذا الرحمة..غير معروفة القراءة.
الشعراء , الاية167.. المخرجين.. المرجومين.. غير معروفة القراءة.
الشعراء , الاية169..مما يعملون.. مما يقولون.. غير معروفة القراءة.
الشعراء , الاية185..المسحرين.. المسخرين.. غير معروفة القراءة.
العنكبوت , الآية61.. يُؤْفَكُونَ.. تؤفكون.. غير معروفة القراءة.
السجدة , الآية 27.. أفلا يبصرون.. افلا تبصرون.. قراءة ابن مسعود
سبأ , الآية40.. يحشرهم..نحشرهم، يقول للملائكة...نقول للملائكة.. قراءة جمهور من القراء وهي رواية أبي بكر عن عاصم.
النمل , الآية81.. فهم مسلمون...فهم مفلحون. . غير معروفة القراءة.
النمل , الآية86، يروا...تروا، ليسكنوا...لتسكنوا..قراءة لبعضهم
النور , الآية41..يفعلون..تفعلون.. على قراءة ابن مسعود و أبي و غيرهم